أنشئت وحدة المتابعة المالية بموجب قرار بقانون مكافحة غسل الأموال وتمويل الارهاب رقم (20) لسنة 2015 وتعديلاته ، كوحدة مستقلة ، وتهدف الوحدة الى مكافحة جريمة غسل الأموال وتمويل الارهاب وحماية الإقتصاد الوطني من الآثار السلبية المترتبة على هاتين الجريمتين، ورفع مستوى نظم وإجراءات مكافحة غسل الاموال وتمويل الارهاب في فلسطين، وتفعيل أطر التعاون المحلي مع كافة السلطات المختصة، وتعمل الوحدة على تنفيذ الأهداف المقرّة من اللجنة الوطنية لمكافحة غسل الأموال وتمويل الارهاب والتي ترسم بدورها السياسات الهادفة لمكافحة هاتين الجريمتين على المستويين المحلي والدولي.